Centrum Myśli Jana Pawła II to także szereg zrealizowanych i docenianych wystaw poświęconych  Janowi Pawłowi oraz najnowszej historii Polski.

Wystawa Papież Wolności

Ekspozycja opowiada o inspirującym wpływie Papieża-Polaka na odzyskiwanie wolności przez narody Europy w latach 80. minionego stulecia. Wystawa „Papież składa się z 30 plansz ze zdjęciami Jana Pawła II z najważniejszych momentów jego długiego pontyfikatu oraz fragmentów najważniejszych wystąpień poświęconych sprawie wolności oraz innym kwestiom społecznym wygłoszonych w Parlamencie Europejskim, Zgromadzeniu Ogólnym Narodów Zjednoczonych i Sejmie. Wystawa zawiera również informacje o spotkaniach Jana Pawła II z najważniejszymi postaciami polityki minionych dziesięcioleci Vaclavem Havlem, Michaiłem Gorbaczowem, Tadeuszem Mazowieckim, Helmutem Kohlem, Jasirem Arafatem i Fidelem Castro. Na zdjęciach zobaczymy również robotników Stoczni Gdańskiej, Prymasa Tysiąclecia kardynała Stefana Wyszyńskiego, Matkę Teresę z Kalkuty ale i Jacka Nicholsona z wpiętym w klapę marynarki znaczkiem „Solidarności”.
Ekspozycja została zaprezentowana na Krakowskim Przedmieściu w Warszawie, a także w Rzymie i Gdańsku.

Obecnie jest eksponowana w siedzibie Centrum Myśli Jana Pawła II przy Foksal 11.

Jan Paweł II. „Źródła”

„Jan Paweł II. Źródła” to tytuł wystawy przygotowywanej przez Muzeum Historii Polski i Centrum Myśli Jana Pawła II z okazji Światowych Dni Młodzieży, które odbyły się w lipcu 2016 roku. Ekspozycję można było zobaczyć na Krakowskim Przedmieściu w Warszawie. Wystawa została objęta honorowym patronatem Prezydenta RP Andrzeja Dudy.

Celem wystawy  było upamiętnienie 1050. rocznicy chrztu Polski, pokazanie intelektualnego oraz  duchowego doświadczenia XX wieku, jak również promowanie historii Polski wśród osób, które pojawią się na Światowych Dniach Młodzieży.

Ekspozycja była prezentowana w specjalnie zaaranżowanym pawilonie, którego projekt powstał w pracowni Nizio Design International.

Obecnie wystawę można obejrzeć pod tym linkiem.

Wystawa „Korzenie wspólnego ducha Europy”

Wystawa „Korzenie wspólnego ducha – Jan Paweł II o Europie” powstała w 208 roku na i była eksponowana w Parlamencie Europejskim w Brukseli.

Głównym celem ekspozycji było przypomnienie wizji Europy, jaką konsekwentnie przez cały swój pontyfikat głosił papież Jan Paweł II. Hasłem przewodnim, zaczerpniętym z nauczania Ojca Świętego, były słowa wypowiedziane w Gnieźnie 3 czerwca 1997 roku: „Nie będzie jedności Europy, dopóki nie będzie ona wspólnotą ducha”. Wystawa przygotowana została w językach krajów Unii Europejskiej oraz po łacinie i po grecku; przedstawia świętych patronów Europy oraz przytacza cytaty Jana Pawła II dotyczące tego kontynentu.

Wystawa organizowana była pod auspicjami prezydent Warszawy Hanny Gronkiewicz-Waltz, kard. Józefa Glempa oraz kard. Stanisława Dziwisza.

Obecnie wystawa jest eksponowana w Instytutach Polskich na całym świecie.